WordPressをサブディレクトリにインストールしたときに、相対パスに変更するようにします。

<?php
//絶対パス→相対パス
class relative_URI {
    public function __construct() {
        add_action('get_header', array(&$this, 'get_header'), 1);
        add_action('wp_footer', array(&$this, 'wp_footer'), 99999);
    }
    protected function replace_relative_URI($content) {
        $home_url = trailingslashit(get_home_url('/'));
        $top_url = preg_replace( '/^(https?:\/\/.+?)\/(.*)$/', '$1', $home_url );
        return str_replace( $top_url, '', $content );
    }
    public function get_header(){
        ob_start(array(&$this, 'replace_relative_URI'));
    }
    public function wp_footer(){
        ob_end_flush();
    }
}
$relative_URI = new relative_URI();
?>

参考サイトはあるのですが、どこのサイトか忘れてしまったため見つけ次第リンク貼らせて頂きます。